Информационное общество – 2030. Политика развития образования Республики Казахстан - стр. 22
7 июня 1999 года был принят Закон Республики Казахстан «Об образовании», который, помимо высшего базового образования (бакалавриат) со сроком обучения 4 года, и высшего научно-педагогического образования (магистратура) со сроком обучения 1–2 года, внедрил в структуру высшего образования «высшее специальное образование» со сроком обучения не менее 4 лет и с присуждением квалификации «специалист с высшим профессиональным образованием».
Таким образом, присвоение высшему образованию статуса специального, впрочем, как и профессионального, приобрело законодательный статус, хотя напрямую противоречит академическому, то есть научно-педагогическому, характеру высшего образования по самым различным и даже особым специальностям.
17 июня 1999 года была подписана Болонская декларация, которая провозгласила принятие европейской системы высшего образования, основанной на двух основных циклах: достепенной – бакалавриате и степенной – магистратуре. Причём доступ к второму циклу предусматривал успешное завершение первого цикла продолжительностью не менее трёх лет.
Таким образом, Казахстан осуществил переход на двух уровневую систему высшего образования несколько ранее подписания Болонской декларации. Однако в течение 5 лет после принятия Закона «Об образовании» высшее специальное образование оставалось основным и единственным уровнем в Казахстане. Только отдельные вузы, имеющие хорошие международные связи, в экспериментальном порядке осваивали образовательные программы бакалавриата и магистратуры.
Прорыв в направлении двухуровневого высшего образования произошёл в 2004 году, когда большинство вузов Казахстана перешли на подготовку бакалавров по четырёхлетним и магистров – по двухлетним образовательным программам. Принят «Классификатор специальностей высшего образования», где указаны специальности бакалавриата и магистратуры, по которым вузы Казахстана могли осуществлять подготовку специалистов. Затем вузовскими коллективами были подготовлены и утверждены Министерством образования и науки Республики Казахстан государственные общеобязательные стандарты образования по подготовке бакалавров и магистров по всем специальностям, указанным в «Классификаторе специальностей высшего образования».
В стандартах по подготовке бакалавров приводился перечень квалификаций и должностей, которые могли занять выпускники данной специальности. В соответствии с этими стандартами основным критерием завершённости образовательного процесса в бакалавриате являлось освоение студентом не менее 128 кредитов, или не менее 5 760 часов теоретического обучения, и не менее 6 кредитов, или 450 часов профессиональной практики. Студент бакалавриата должен был освоить 75–91 кредит, или 3 375–4 095 часов по обязательному компоненту, и 38–58 кредитов, или 1 710–2 385 часов по компоненту по выбору.