Устроители Туркестана. Туркестанские генерал-губернаторы - стр. 47
Таким образом, миссия Н. Г. Столетова из дипломатической победы России превратилась в её поражение. Более того, стала причиной второй англо-афганской войны. Петербург предал своего афганского союзника и это предательство, по выражению А. А. Семёнова, стало причиной «безвозвратного» падения русского престижа в Афганистане, где потом о русских «не могли слышать без ненависти».
Шер-Али осознав, что помощи от России не будет, тем не менее, решил сражаться на подступах к столице. Однако глава русской миссии генерал Разгонов убедил эмира не рисковать, а покинуть Кабул и на севере страны собирать силы для отпора агрессии.
1 декабря назначив своего сына Якуб-хана главнокомандующим афганской армии, эмир выехал из Кабула в Мазари-Шариф. Вслед за ним выехало в Ташкент и русское посольство.
Тем временем, наступление британцев застопорилось. Афганцы перед лицом общей угрозы создали «союз афганских племен», во главе которого встали авторитетный 90-летний мулла Мушки Алим и афганский генерал Мухаммед Джан-хан. Против оккупантов было собрано 25-тысячное ополчение, отчаянно сражавшееся с оккупантами. Фактически в результате зимней кампании англичане смогли завладеть лишь узкой полосой местности по которой пролегала дорога, связывающая Пешавар с Кабулом. Но и этот успех был достигнут дорогой ценой. Как писал о начальном периоде этой войны А. Е. Снесарев: «Она ясно обнаружила органические недостатки британской военной системы: слабую подготовку оперативных планов, неумение обеспечивать свои сообщения, обременение отрядов массой нестроевых и полное подчинение военных операций политическим соображениям».
И неизвестно, чем обернулась бы для британской армии летняя кампания, но тут судьба преподнесла им подарок. В феврале 1879 года умирает от гангрены Шер Али-хан, и эмиром провозглашается его сын Якуб.
Перед новым правителем встал выбор: либо продолжить сопротивление, либо пойти на мирное соглашение. После недолгих колебаний он выбрал последнее. Вступив в переписку с английским агентом Каваньяри, молодой эмир в начале мая отправляется в селение Гандамак под Джелалабадом на встречу с англичанами. Интересно, что одежда, в которой Якуб-хан прибыл на переговоры, удивительно напоминала русский генеральский мундир.
26 мая между Якуб-ханом и представителем Британии Луи Каваньяри был подписан мирный договор, превращающий Афганистан в английского вассала. В соответствии с ним эмир отказывался от собственной внешней политики – только с разрешения Британии Афганистан мог вступать в переговоры с другими странами. В Кабуле размещалось английское посольство, английские офицеры имели право посещать любой пункт афганской границы, в любое время. Рынки Афганистана открывались для английской торговли. Ряд территорий, включая Хайберский проход переходил под контроль Англии. Всем, кто сотрудничал с британцами во время войны должна была быть объявлена амнистия. Самому эмиру назначалась от британских властей ежегодная субсидия в 600 тысяч рупий.