Чако, 1928-1938. Неизвестная локальная война. Том I - стр. 67
Различие социально-экономических систем, а также отсутствие четко демаркированных границ и амбиции президента Ф.С. Лопеса способствовали возникновению войны Тройственного Альянса (1864-1870 гг.), опустошившей Парагвай и повернувшего его на путь большинства республик Латинской Америки. Несмотря на отчаянное сопротивление парагвайцев, призвавших в ряды своей армии даже женщин, страна потерпела катастрофическое поражение. Число жителей за время войны из-за голода и болезней уменьшилось до 230000 человек, из которых только 29000 составляли мужчины и 106000 – женщины. Республика была оккупирована бразильскими войсками и была на грани поглощения Аргентиной и Бразилией. Только ювелирное лавирование между империей и конфедерацией позволили послевоенным парагвайским политикам сохранить независимость страны. В конце концов Парагвай сохранил свою независимость, но вынужден был уступить 156 тысяч квадратных километров – половину своей территории Бразилии (территория Пунта-Поран на юге Мату-Гросу) и Аргентине (междуречье Пилькомайо и Беремехо) и выплатить контрибуцию в 236 млн. песо. Бразильский гарнизон размещался в столице республики до 22 июля 1876 года. Аргентина гораздо раньше вывела свои войска, оставив небольшой отряд в Вилье-Оксиденталь, расположенной в месте слияния рек Пилькомайо и Парагвай.
Сразу после окончания войны союзники превратились в соперников за влияния в Парагвае. Это стало причиной сохранения независимости страны: каждая из держав-победительниц противодействовала экспансии другой. Так, бразильцы сразу отвергли кандидатуру аргентинского генерала, парагвайца по происхождению, Х.А.Гелли-и-Обреса на пост президента страны. Избегая открытой конфронтации, дипломаты обеих стран пытались поставить под контроль парагвайское правительство, поддерживая тех или иных политиков. Пришедшие к власти противники режима Лопесов попытались создать модель общества, основанную на принципах либерализма и свободного предпринимательства. Дальнейшее его развитие привело к возникновению двухпартийной системы в стране и проникновению иностранного капитала в ее экономику. 22 июля 1869 года в Национальном Театре собрались 130 представителей парагвайской общественности, которые из своей среды выбрали 21 депутата. Они избрали пятерых электоров, которые, в свою очередь, должны были назначить трех триумвиров временного правительства. За несколько месяцев до этого события возникли две основные политические группы, которые в течение всего последующего времени определяли политическое развитие страны. Так, 31 марта 1869 года возник Клуб Союз за Республику под председательством Фернандо Итурбуру. По официальным данным он насчитывал 338 членов, но активной политической деятельностью занималась только треть из них. В клубе были как сторонники режима Ф.С.Лопеса (